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 盲腸炎誤診的情況不少，主要原因是因為盲腸炎的主訴症狀與其他腹痛疾病類似，例如盲腸雖然位於右下腹部，但其神經分佈與上腹部重疊，因此一開始痛的位置往往是上腹部，與膽囊發炎、腸胃炎的症狀頗為類似。
另外盲腸發炎形成局部刺激，病人有時會出現腹瀉、嘔吐等症狀，也和腸胃炎相似，再加上抗生素使用過於氾濫，如果一開始就先投予抗生素，將發炎症狀暫時壓制，即使抽血也驗不出白血球異常升高，就更容易被忽略了。
除了症狀不容易分辨之外，有些特殊族群也比較容易誤診，其中包括老年人、小孩、孕婦及肥胖者。
老年人因對疼痛較遲鈍，且因免疫力較差，驗白血球較不準，而小孩表達能力較差，而症狀很像腸胃炎或腸阻塞，肥胖者因腹部脂肪多，若以觸診來診斷也不夠準確，另外孕婦容易因為以為是一般的腹痛或是害喜而忽略。
在臨床上，容易與急性闌尾炎混淆的腹部急症包括：
• 急性腸胃炎
• 大腸憩室炎
• 腸繫膜淋巴炎
• 克隆氏迴腸炎
• 假膜性大腸炎
• 盲腸迴盲瓣腫瘤
• 如果是女性更容易與骨盆腔發炎、輸卵管炎、子宮外孕、卵巢囊腫破裂、泌尿系統發炎或結石、膽囊炎、胰臟炎、腸阻塞及十二指腸穿孔等等相混，不得不小心。
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